某商貿公司因為資金周轉出現困難，決定向某諮詢公司借款50萬元，雙方簽訂《借款合同》，約定由諮詢公司支付100萬元給商貿公司，商貿公司2個月後歸還借款，並附加銀行同期利息。合同生效后，諮詢公司交付了支票，但是2個月後商貿公司一直以種種借口未按合同約定歸還借款及利息。諮詢公司也面臨資金問題，與商貿公司協商，但沒有結果，於是向人民法院提起訴訟，要求商貿公司返還其借款50萬元，並支付銀行同期利息。是借款合同被人民法院確認為無效合同，商貿公司依無效合同佔用諮詢公司大量資金，怎麼辦？